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Sessions PostersPoster 1 Criblage de molécules inhibitrices des nécroses régulées Autret A (1) ; Belal S (1) ; Comte A (3) ; Baratte B (2)(4) ; Robert T (2)(4) ; Bach S (2)(4) ; Delehouzé C (1) ; Rousselot M (1) (1) SeaBeLife Biotech, Roscoff, France (2) UMR8227 CNRS/SU, Station Biologique de Roscoff, France (3) ICBMS/CNRS UMR5246, Univ. Claude Bernard, Lyon, France (4) FR2424 CNRS/SU, KISSf, Station Biologique de Roscoff, France
Seabelife Biotech développe des petites molécules inhibitrices des nécroses régulées, à savoir la nécroptose et la ferroptose. Ces deux voies de morts cellulaires ont des mécanismes de régulation distincts, et jouent un rôle important dans le développement de pathologies graves touchant des organes vitaux telles que les maladies inflammatoires, les infections virales, les maladies neurodégénératives (Parkinson, Alzheimer), les troubles cardiovasculaires ou encore les insuffisances hépatiques et rénales. La nécroptose, déclenchée par un signal de mort, comme la cytokine TNF-α, dépend principalement de l’activité des kinases RIPK1 et RIPK3 (receptor-interacting protein kinase 1 et 3). En revanche, la ferroptose est provoquée par la peroxydation excessives des lipides membranaires, catalysée par le fer libre intracellulaire. Cette accumulation est régulée par l’enzyme GPX4, qui joue un rôle crucial dans la protection des cellules contre le stress oxydatif. Au laboratoire, des essais de criblages phénotypiques ont été développés dans le but d’identifier des inhibiteurs de ces deux voies de mort cellulaire. Les hits ainsi découverts sont ensuite validés et caractérisés selon le type d’inhibiteur (i.e. nécroptose, ferroptose ou dual), sur des modèles de nécroptose et de ferroptose par des essais cellulaires et moléculaires complémentaires.
Poster 2 Développement d'un modèle de poumon-sur-puce immunocompétent mimant la barrière alvéolaire humaine pour l'étude de l'infection par Mycobacterium tuberculosis
Priscille BRODIN Directrice de Recherche à l’INSERM, Cheffe d’équipe, Univ. Lille, CNRS, Inserm, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019 - UMR9017 - CIIL - Centre d'Infection et d'Immunité de Lille, F-59000 Lille, France https://www.ciil.fr/teams/chemical-genomics-of-intracellular-mycobacteria-cgim Auteurs: Deboosere Nathalie, Dagan Yoël, Burette Aurélie, Delannoy Elise, Brodin Priscille & Grassart Alexandre Institutions: Univ. Lille, CNRS, Inserm, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019 - UMR 9017 - CIIL - Center for Infection and Immunity of Lille, F-59000 Lille, France Contexte et objectifs Les organes-sur-puce sont de nouveaux modèles de culture cellulaire tridimensionnels repdroduisant certaines caractéristiques physiologiques clés des organes. Ce travail a deux objectifs majeurs : (i) développer une méthodologie basée sur la lithographie douce et l'impression 3D pour fabriquer un modèle de poumon-sur-puce humain, (ii) appliquer ce modèle pour mieux comprendre les interactions entre Mycobacterium tuberculosis (Mtb) et les cellules hôtes. Méthodes Résultats Nous avons étudié l'infection par Mtb dans notre modèle de barrière alvéolaire. Les expériences d'infection réalisées dans les LoC ont donné des résultats comparables au modèle de culture 2D (plaque de culture). Les cellules épithéliales ont montré un faible niveau d'infection un jour après l'infection, et une diminution du pourcentage de cellules infectées a été observée après une infection prolongée (Jour 5), suggérant l'absence de réplication bactérienne dans ces cellules. Ensuite, des macrophages humains dérivés de PBMC ont été ajoutés à la couche de cellules épithéliales avant l'infection par Mtb pour mimer le rôle des macrophages alvéolaires, la niche physiologique principale pour la réplication de Mtb. Les macrophages humains marqués par fluorescence se sont effectivement fixés à la couche épithéliale et la colonisation intracellulaire des phagocytes par Mtb a augmenté au cours des cinq jours d'infection, indiquant une réplication active. Conclusion
Poster 3 Inhibition of 3CLpro enzymes of four coronaviruses : from High Throughput Screening to positive confirmation Paul Carré1, Valerie Landry1-2, Hugo Hennequin1, Xavier Hanoulle3, Julie Charton1, Benoit Deprez1-2, Florence Leroux1-2 1U1177 - Drugs and Molecules for Living Systems. Institut Pasteur de Lille, Université de Lille, Inserm, F-59000 Lille, France 2UAR2014-US41-ARIADNE Criblage. Plateformes Lilloises en Biologie et Santé, 59000 Lille, France 3EMR9002 – Biologie Structurale Intégrative. CNRS, F-59000, Lille, France
Le virus SARS-CoV-2 est responsable de la pandémie de COVID-19 et d’infections potentiellement mortelles qui continuent d’affecter des millions de personnes dans le monde. La protéase 3CLpro est une protéase à cystéine impliquée dans le clivage des polyprotéines virales constituant une étape cruciale de la réplication virale. Cette protéase est conservée parmi les autres coronavirus comme le SARS-CoV-1 ; MERS-CoV et HCoV-229E. Elle constitue ainsi une cible thérapeutique pertinente pour le développement d’antiviraux à large spectre et de lutte contre l’émergence de futurs coronavirus. Nous avons optimisé puis réalisé un criblage à haut-débit de 146 composés sur les 4 enzymes 3CLpro des coronavirus SARS-CoV-2 ; SARS-CoV-1 ; MERS-CoV et HCoV-229E en dose-réponse. Nous avons obtenu 108 composés sur le criblage 3CLpro SARS-CoV-2 pour lesquels nous avons déterminé une valeur de pIC50 correspondant à plus de 70% d’inhibition de l’activité enzymatique. 98 produits sur 3CLpro SARS-CoV-1 ont des pIC50 comparables avec les résultats sur 3CLpro SARS-CoV-2. Nous avons ensuite confirmé 17 composés sur 3CLpro MERS-CoV en utilisant deux protocoles. Enfin, nous avons identifié 15 composés avec des pIC50 sur 3CLpro HCoV-229E. Pour conclure, ce sont 15 analogues qui ont été identifiés comme composés pan-inhibiteurs, avec un composé (Δ262) comme étant l’analogue le plus actif sur les 4 enzymes virales.
Poster 4 Plate-forme de criblage chémogénomique et biologique (PF-CCB) à l’Institut Pasteur : notre expertise au service de vos projets de découverte de médicaments Alix Boucharlat(1), Agnès Zettor(1), Marine Ghazarian(1), Emilie Giraud(1),Jeanne Chiaravalli(1) & Fabrice Agou(1) (1) Plate-Forme de Criblage Chemogénomique et Biologique, Centre de Ressources et Recherches Technologiques (C2RT), Institut Pasteur, CNRS UMR 3523, Paris, France La plate-forme de criblage chémogénomique et biologique (PF-CCB) de l’Institut Pasteur à Paris joue un rôle central dans la découverte de médicaments, en favorisant le développement de nouvelles thérapies et en décryptant les mécanismes moléculaires sous-jacents. La PF-CCB accompagne les chercheurs dans la mise en place et l'optimisation de leurs tests de criblage à haut débit (HTS) basés sur des cibles et des criblages phénotypiques (HCS). Pour le HCS, les analyses phénotypiques peuvent être réalisées avec un microscope automatisé conventionnel (IX83, Olympus) ou le StellarVision (Rebus Biosystems, USA) utilisant une illumination structurée et optique à ouverture synthétique (SAO). Pour le criblage HTS, nous proposons des tests cellulaires et biochimiques avec une large gamme de techniques de détection (absorbance, anisotropie de fluorescence, AlphaScreen, HTRF, luminescence et TSA). Nous sommes également équipés des systèmes Octet HTX (Sartorius) et Wave Delta (Creoptix, Malvern Panalytical), permettant la détection à haut débit sans marquage via l’interférométrie en couche mince (BLI) ou couplée à un réseau (GCI). La PF-CCB possède une collection de plus de 76,000 composés issus de banques commerciales ou originales provenant des chimistes de l’Institut Pasteur. Grâce à notre distributeur acoustique de précision, nous pouvons reformater des plaques multi-puits, proposer un service de "cherry-picking" et préparer des plaques filles à partir de nos collections. Un service analytique de contrôle qualité est également en place pour valider et parfois prioriser les composés identifiés lors des criblages par diffusion de lumière dynamique (DLS) et LC-MS. Enfin, nous réalisons des études précliniques sur de petites molécules et des produits biologiques, ainsi que des tests de vaccins sur des modèles animaux, incluant les souris, rats et hamsters.
Poster 5 ILLUMINATING THE DARK KINOME: Theo WERTH,1 Morgan LELIEVRE, 2 Stéphane BACH,² Thomas ROBERT,2 Alban LEPAILLEUR1 et Johanna GIOVANNINI1 1 Centre d’Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Normandie Univ, UNICAEN, 14000 Caen, FRANCE. 2 Sorbonne Université, CNRS, UMR 8227, Integrative Biology of Marine Models Laboratory (LBI2M), Station Biologique de Roscoff, 29680 Roscoff, France &Sorbonne Université, CNRS, FR 2424, Plateforme de Criblage KISSf (Kinase Inhibitor Specialized Screening facility), Station Biologique de Roscoff, 29680 Roscoff Cedex, FRANCE johanna.giovannini@unicaen.fr
“Dark Kinome” fait référence aux kinases dont la structure ou la fonction reste relativement inconnue. À ce jour, il y a toujours 31 kinases classées comme "dark". Malgré le manque de leur compréhension complète, il est maintenant clair que les dark kinases sont impliquées dans plusieurs pathologies, notamment le cancer et les maladies neurodégénératives. [1, 2, 3] Ainsi, le Dark Kinome constitue une source inexplorée de cibles thérapeutiques innovantes pour la recherche médicinale. Pour illuminer le Dark Kinome, nous nous sommes plongés dans la modélisation par homologie et le criblage in silico. Avec notre partenaire de la Station Biologique de Roscoff, KISSf, nous avons accès à la validation in vitro de notre criblage in silico. Ensuite, en appliquant des méthodes de conception rationnelle de médicaments (Drug Design), nous visons à proposer de nouveaux inhibiteurs de kinases qui : - Serviront de sondes chimiques pour révéler le rôle de ces Dark Kinases dans les modèles in cellulo et in vivo, - Seront utilisés, nous l’espérons, comme nouvelles entités chimiques ouvrant la voie à l'inhibition des kinases sombres. Bibliographie : [1] Berginski et al., The Dark Kinase Knowledgebase: an online compendium of knowledge and experimental results of understudied kinases, Nuc Ac Res 49, D529–D535 (2021); [2] darkkinome.org; [3] Vella et al., Diving into the dark kinome: lessons learned from LMTK3. Cancer Gene Ther 29, 1077–1079 (2022).
Poster 6 Identification de nouveaux candidats médicaments anticancéreux à partir de la chimiothèque Prestwick : effets comparés sur des cellules cancéreuses gastriques en 2D vs. 3D Clara Gouez, George Alzeeb, Danielle Arzur, Laurent Corcos & Catherine Le Jossic-Corcos Univ Brest, Inserm, EFS, UMR 1078, GGB, 22 Avenue Camille Desmoulins, F-29200 Brest, France Le cancer gastrique (CG) représente la quatrième cause de mortalité liée au cancer dans le monde. L'incidence du CG dans le département du Finistère est la plus élevée de France. Souvent diagnostiqué à un stade avancé, le pronostic des patients atteints de CG demeure défavorable, malgré la disponibilité de nombreux agents thérapeutiques dont l'efficacité reste cependant limitée. Dans ce contexte, notre équipe a exploré la possibilité d’un repositionnement thérapeutique. Ainsi, un criblage pharmacologique a été initié par George Alzeeb à l'aide de la chimiothèque Prestwick, comprenant 1520 médicaments déjà commercialisés et couvrant une large gamme d'indications thérapeutiques. Ce criblage a été réalisé sur des cultures de sphéroïdes tridimensionnels (3D) dérivés de la lignée cellulaire cancéreuse gastrique humaine HGT-1. Cette première étape a permis d’identifier 90 molécules (par test MTT) capables de réduire la survie cellulaire à moins de 25 %. Par la suite, 19 de ces molécules ont été testées en culture bidimensionnelle (2D) et 3D en utilisant les modèles cellulaires HGT-1 et AGS (une autre lignée cellulaire cancéreuse gastrique humaine), ainsi que des cellules HEK293 (lignée cellulaire rénale embryonnaire humaine) utilisées comme contrôle non cancéreux. Trois de ces molécules, non utilisées actuellement dans le traitement du cancer, ont montré une cytotoxicité marquée en tant qu'agents seuls, avec des taux de toxicité variant de 51 % à 94 % selon la lignée cellulaire après 48 heures de traitement dans des modèles 2D. L’effet de la combinaison de ces molécules avec différentes chimiothérapies de référence a été évalué dans des modèles 2D et 3D, révélant une activité synergique significative entre une molécule identifiée et le 5-fluorouracile (5FU), augmentant la toxicité de 40 % pour le 5FU seul à 80 % en combinaison. Des analyses de séquençage de l’ARN (RNAseq) sont en cours afin de comparer les profils d’expression génique des cellules cancéreuses gastriques cultivées en 2D et en 3D, ainsi que leur réponse aux traitements. Des analyses supplémentaires visent à déterminer le type spécifique de mort cellulaire induit par ces agents, incluant potentiellement l’apoptose, la nécroptose ou la ferroptose. Enfin, nous prévoyons d’étudier les effets de ces combinaisons de médicaments dans des sphéroïdes bicellulaires associant des cellules cancéreuses épithéliales à des fibroblastes associés au cancer (CAF), afin de mieux reproduire la complexité des tumeurs in vivo. Mots clés : Cancer gastrique ; Repositionnement thérapeutique ; Criblage pharmacologique ; Sphéroïdes.
Poster 7 Systèmes de criblage pour la recherche de molécules antivirales contre les virus émergents Nathalie Gros1, Christine Chable-Bessia1, Aymeric Neyret1,2, Sébastien Lyonnais1, Liubov Cherkashchenko3, Grégor Dubois1, Floriane Gucciardi1, Andres Merits3 et Delphine Muriaux1,2 1-CEMIPAI UAR3725, CNRS & Université de Montpellier, Montpellier, France 2-IRIM UMR9004, CNRS & Université de Montpellier, Montpellier, France 3-Institute of Technology, University of Tartu, Tartu, Estonia
Le centre d’études des maladies infectieuses et pharmacologie anti-infectieuse, CEMIPAI est une plateforme mixte CNRS – Université de Montpellier mise à la disposition des chercheurs académiques et privés pour l’étude des virus pathogènes de classe 3 et pour la recherche de molécules antivirales ou anticorps neutralisants. Nous présentons ici notre virothèque et les systèmes de criblage mis au point et validés sur la plateforme, centrés sur les virus émergents : SARS-CoV-2 et arbovirus. La pandémie liée à l’apparition du SARS-CoV-2 nous a conduit à développer des systèmes de production, de titration et de criblage contre ce virus pour une recherche rapide de molécules antivirales. Nous présentons ces systèmes, incluant (i) des systèmes de criblage sur différentes souches du virus SARS-CoV-2 et différents types cellulaires (VERO E6, A549-hACE2, Calu-3), (ii) des tests de micro-neutralisation sur échantillons de sérums, plasmas, salives. Ces systèmes sont calibrés par des molécules de référence et des anticorps neutralisants, associés à des tests de RT- qPCR. De nombreux projets ont ainsi pu être réalisés et apporter appui à la réalisation de travaux académiques et privés. Les arbovirus, dont les flavi- et alphavirus, représentent également un problème de santé publique majeur et une menace croissante autour de la Méditerranée et dans les DROM-COM. Le criblage de molécules contre ces virus reste un enjeu crucial pour l'identification de traitements anti-infectieux. Or, les génomes ARN des flavi- et alphavirus ont une faible tolérance aux insertions de gènes rapporteurs, les virus portant des modifications sont souvent génétiquement instables. Nous avons développé puis sélectionné dans ce contexte une nouvelle génération d’arbovirus (Chikungunya, Zika et Dengue-2) génétiquement modifiés et stables pour induire une fluorescence ou la production de NanoLuciferase dans les cellules infectées. Des systèmes de criblage de molécules ou d’anticorps ont ainsi pu être développés à partir de ces virus rapporteurs.
Poster 8 High-throughput screening for discovering bioactive compounds that modulates antigen presentation Laetitia Lesire1, Adrien Herledan1-2, Florence Leroux1-2, Cyril Couturier1-2, Benoit Deprez1-2,Rebecca Deprez-Poulain1 1Univ. Lille, Inserm, Institut Pasteur de Lille, U1177- EGID - Drugs and Molecules for Living Systems, F-59000 Lille, France 2UAR2014-US41-ARIADNE Criblage. Plateformes Lilloises en Biologie et Santé, 59000 Lille, France La présentation antigénique est un processus par lequel une cellule de l’organisme présente des peptides antigéniques via son CMH de classe 1 aux lymphocytes T cytotoxiques. Ce phénomène permet la reconnaissance et l’élimination des cellules anormales. Cependant, un dérèglement du système immunitaire causé par un défaut de présentation antigénique peut être responsable du développement de maladies auto-immunes et de cancer. Trouver des modulateurs de la présentation antigénique constitue alors une opportunité thérapeutique pour le traitement de ces maladies. Le laboratoire INSERM U1177 développe des inhibiteurs des enzymes ERAPs impliquées dans le clivage des peptides antigéniques dans le réticulum endoplasmique pour la présentation sur le CMH de classe 1. Nous avons développé un essai de présentation antigénique basé sur la transfection transitoire de cellules HEK-293 par un plasmide codant pour 1/ un précurseur de peptide antigénique L-SIINFEKL, qui pourra être pris en charge par les ERAPs pour produire le peptide antigénique SIINFEKL, 2/ le CMH de classe 1 de souris H2KB présentant un tag HiBit de la nanoluciférase ainsi 3/ qu’un inhibiteur du transporteur des peptides antigéniques endogènes TAP. Nous avons criblé 2806 composés dans un essai homogène permettant la mesure de la présentation antigénique par complémentation de la nanoluciférase en luminescence ainsi que la mesure de la viabilité cellulaire par la quantification de l’ATP dans les cellules. Nous avons ensuite confirmé la sélectivité des composés dans un essai orthogonal en immunofluorescence par l’utilisation d’un anticorps dirigé contre le complexe H2KB/SIINFEKL. Enfin, les composés confirmés ont été testés dans un essai secondaire de co-culture avec des lymphocytes T cytotoxiques, activés par cette présentation antigénique. L’ensemble de ces essais a permis l’identification de deux composés dont un médicament qui n’est pas décrit dans la littérature pour cette activité. Enfin, une famille chimique d’inhibiteurs de la nanoluciférase a été identifié comme interférent à la technologie de luminescence du test.
Poster 9 Contrôle optique des récepteurs membranaires avec le lecteur µCELL FDSS (Hamamatsu) et le système développé par la plateforme ARPEGE en partenariat avec la société DIPSI Damien Maurel, Anaëlle Dumazer, Cyril Goudet, Fabrice Dubois, Stéphane Bedut, Jean-Marc Dangelo, Laurent Prézeau En combinant lumière et molécules photosensibles, la photopharmacologie ouvre de nouvelles perspectives pour contrôler et réguler l'activité de cibles endogènes dans les tissus. En partenariat avec la société DIPSI et l'équipe du Dr. Lebon à l'IGF, la plateforme ARPEGE a mis au point un dispositif innovant adapté au lecteur FDSS microCELL (Hamamatsu) pour photocontrôler précisément l’activation de récepteurs membranaires par la lumière en permettant simultanément de suivre des évènements intracellulaires, première étape pour la caractérisation in vitro de molécules photosensibles.
Poster 10 La Plateforme Intégrée de Criblage de Toulouse (PICT) : du criblage au design moléculaire Nahoum Virginiea* a. Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale, IPBS, Université de Toulouse, CNRS, UPS, 31077, Toulouse, France. * Correspondance : pict@ipbs.fr La plateforme PICT propose une approche globale reposant sur des champs d’expertise complémentaires développés par trois laboratoires partenaires : l’Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), le laboratoire de Synthèse et physicochimie de molécules d'intérêt biologique (SPCMIB) et le Toulouse biotechnology institute (TBI). Ces laboratoires mènent activement des recherches de pointe dans leur propre domaine et dédient savoir-faire technologique, équipements et personnels à la plateforme. PICT met à disposition de ses utilisateurs les outils et l’expertise scientifique nécessaires à la détermination de structures macromoléculaires par cristallographie aux rayons X et RMN, la modélisation moléculaire et le criblage in silico, le criblage et la mesure d’interactions par des approches biophysiques, la synthèse chimique pour le développement de bibliothèques de composés focalisées et l’optimisation de ligands « hit-to-lead », l’analyse, la purification et l’identification de diverses familles de molécules et de protéines de faible poids moléculaire, l’ingénierie, l’évolution dirigée et le criblage à haut débit des enzymes optimisées, et enfin, la métagénomique fonctionnelle pour la découverte de nouvelles enzymes. La plateforme offre également un accès à ses bibliothèques de fragments (~ 1 000), de produits chimiques (> 11 000) et de peptides (> 20 000). PICT occupe ainsi une position centrale dans le processus de développement de nouveaux médicaments, en aval de la découverte et de la validation d’une cible thérapeutique et en amont des études ADMET (Absorption, Distribution, Métabolisme, Élimination, Toxicité) et de la pharmacologie clinique. Keywords: Criblage ; Biophysique structurale; Synthèse chimique ; Chromatographie; Découverte/ingénierie d’enzymes
Poster 11 NOUVELLE CIBLE PHARMACOLOGIQUE POUR LUTTER CONTRE LA VIBRIOSE Florent Rouvier, Barbara Cardoso-Domingues, Jean-Michel Brunel, Jean-Michel Bolla, Véronique Sinou UMR_MD1, MCT, Faculté de Pharmacie, 27 Bd Jean Moulin, 13385 Marseille.
L’aquaculture en produisant plus de la moitié de la consommation humaine d’animaux aquatiques joue un rôle essentiel dans la sécurité alimentaire de nombreux pays. Cependant, le revers du développement rapide de ce secteur est l’apparition de maladies d'origine bactérienne ayant entrainé un usage croissant d’antibiotiques avec pour conséquence le développement de bactéries résistantes. Selon l’Organisation Mondiale de la Santé, l’antibiorésistance constitue aujourd’hui l’une des plus graves menaces pour la santé mondiale. Pour lutter contre ce fléau, l’approche conjointe santé publique, animale et environnementale dite « One Health » est indispensable. Le projet européen InovAQtion s’inscrit dans le cadre de cette approche et a pour objectif d’identifier des alternatives pour prévenir la vibriose causée par des bactéries pathogènes du genre Vibrio dans les élevages aquacoles. Un criblage phénotypique effectué sur des isolats de V. harveyi collectés sur les parois de bassins et des poissons morts de vibriose a permis d’identifier une série d’analogues synthétiques des polyamines (composés MB) capables d’inhiber la croissance bactérienne. Cette inhibition diminue avec l’augmentation de la longueur de chaîne carbonée suggérant que ces composés ciblent une enzyme. La levée de l’inhibition de la croissance bactérienne par le composé MB18 par l’ajout de polyamines endogènes substrats de l’enzyme carboxynorspermidine synthase (CANSDH) et l’inhibition de la CANSDH in vitro suggèrent que les composés MB sont des inhibiteurs compétitifs de la CANSDH. Cette enzyme est impliquée dans une voie alternative de biosynthèse des polyamines spécifique des Vibrio. Afin de confirmer cette hypothèse, des études structurales sont en cours de réalisation.
Poster 12 PCBIS: Chemical libraries, biological models, technological tools and early ADMETox for laboratories Adeline Obrecht1, Christel Valencia1, Valérie Calco1, Bruno Didier1,2, Sophie Gioria1, Claire Marsol1,2, Patrick Gizzi1, Claire Bourban1, François Daubeuf1, Christine Lehalle1 Romain Hany1, Renaud Wagner (1), Valérie Kugler (1), Gabrielle Zeder-Lutz (1), Delphine Garnier (1), Cheng Deng (1), Magali Schwoob (1), Fanny Pestre-Sorge (1), Justine Marc (1), Pascal Villa1 1UAR 3286 PCBIS, CNRS-University of Strasbourg 300 Bld Brant 67412 Illkirch 2UMR 7200 LIT, CNRS-University of Strasbourg 72 rue du Rhin 67400 Illkirch
PCBIS : an ISO 9001-certified laboratory dedicated to the identification of active molecules. As a research or service provider, PCBIS offers its skills to the scientific community: development of miniaturized molecular or cellular bioassays robotized screening of molecule collections management and hosting of collections of synthetic or pure natural molecules (chemical libraries) identification of active compounds post-screening analysis of structure-activity relationships search for new compound structures by analogy in databases study of physico-chemical and pharmacokinetic properties (ADME-Tox) supervision and training of users on our apparatus and technologies References 1) Gilles M, Baybekov S, Llompart P, Gizzi P, Galzi JL, Ramos P, Saurel O, Bourban C, Minoletti C, Varnek A. Kinetic solubility: experimental and machine-learning modeling perspectives. Mol Inform. 2023 Dec 27. doi:10.1002/minf.202300216 2) Maujean T., Wagner P., Valencia C., Riché S., Iturrioz X., Villa P., Girard N., Karpenko J., Gulea M., Bonnet D. Rapid and Highly Selective Fluorescent Labeling of Peptides via a Thia-Diels-Alder Cycloaddition: Application to Apelin. Bioconjugate Chem. 2023, 34, 162-168. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00500 3) Pierrevelcin M, Flacher V, Mueller CG, Vauchelles R, Guerin E, Lhermitte B, Pencreach E, Reisch A, Muller Q, Doumard L, Boufenghour W, Klymchenko AS, Foppolo S, Nazon C, Weingertner N, Martin S, Briandet C, Laithier V, Di Marco A, Bund L, Obrecht A, Villa P, Dontenwill M, Entz-Werlé N. Engineering Novel 3D Models to Recreate High-Grade Osteosarcoma and its Immune and Extracellular Matrix Microenvironment. Adv Healthc Mater. 2022 Sep 4:e2200195. doi:10.1002/adhm.202200195 4) Eguida M., Schmitt-Valencia C., Hibert M., Villa P., Rognan D. Target-focused library design by pocket-applied computer vision and fragment deep generative linking. J. Med. Chem. 2022, 65, 13771-83. Doi :10.1021/acs.jmedchem.2c00931 5) Megat S, Hugel S, Journée SH, Bohren Y, Lacaud A, Lelièvre V, Doridot S, Villa P, Bourguignon JJ, Salvat E, SchlichterR, Freund-Mercier MJ, Yalcin I and M Barrot Antiallodynic action of phosphodiesterase inhibitors in a mouse model of peripheral nerve injury. Neuropharmacology 205 (2022) DOI: 10.1016/j.neuropharm.2021.108909
Poster 13 New High Speed, High Sensitivity and Compact Confocal Unit for Microscopy Le système MAICO® est une unité confocale compacte, à haute vitesse et sensibilité, idéale pour l'imagerie de cellules vivantes. Il permet un balayage rapide jusqu'à 76 images par seconde grâce à un miroir MEMS, tout en minimisant la phototoxicité. Sa structure modulaire permet d'ajouter jusqu'à 4 canaux d'observation simultanés. Avec des détecteurs à haute sensibilité, il optimise l'imagerie à faible puissance laser. MAICO® est particulièrement adapté à l'observation de phénomènes rapides et l'imagerie de structures cellulaires complexes.
Poster 14 New Light-sheet Microplate Cytometer for 2D and 3D Cell Cultures Le CYTOQUBE® est un cytomètre à plaque qui utilise l'optique par feuille de lumière pour l'imagerie fluorescence 3D à haute vitesse, appliquée aux cellules 2D et 3D. Grâce à la technologie brevetée Zyncscan®, il réalise des analyses rapides et quantitatives de l'intensité et de la morphologie cellulaire. CYTOQUBE® scanne les plaques de 96, 384 et 1536 puits, fournissant des images 3D détaillées avec séparation en temps réel du fond. Conçu pour le criblage de médicaments, les évaluations de toxicité et la recherche translationnelle, il simplifie l'imagerie haute résolution tout en minimisant les effets de photoblanchiment.
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MedChemExpress (MCE) est un fournisseur mondial de réactifs de recherche scientifique. Nous proposons une large gamme de produits de haute qualité utilisés dans la recherche médicale, pharmaceutique, biologique et chimique. Notre catalogue comprend des inhibiteurs, des anticorps, des sondes biochimiques, des réactifs pour la biologie moléculaire et des composés destinés au criblage de petites molécules.
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Poster 16 Greenpharma – Prestwick Chemical : Catalyseurs de votre recherche de médicaments en oncologie La découverte de médicaments est un processus long, coûteux et à haut risque, avec un faible taux de réussite. Il est donc devenu urgent de trouver de nouvelles stratégies pour surmonter ces défis. Parmi les différentes approches, la réutilisation ou le repositionnement des médicaments a suscité beaucoup d’intérêt ces dernières années. Afin de réaliser cette stratégie et accélérer la découverte de nouveaux hits/leads, une gamme d'outils précieux pour l’identification de nouvelles applications pour les anciens médicaments a été développée Parmi ces outils, des chimiothèques de criblage chimique très pertinentes et intelligentes ont été conçues pour garantir les performances du criblage. En particulier, des collections de médicaments approuvés, de fragments de médicaments et, plus récemment, de combinaisons de médicaments. En effet, la thérapie combinée s'est avérée être une approche exceptionnelle dans différents domaines thérapeutiques, en particulier en oncologie où la résistance au traitement constitue un problème majeur. Par conséquent, la combinaison de médicaments ayant différents mécanismes d’action peut induire une déstabilisation du processus de survie de la tumeur, créer des synergies pharmacologiques, augmenter l’efficacité des traitements anticancéreux actuels et potentiellement diminuer la toxicité et la résistance aux médicaments. En outre, une fois qu'une « touche » est trouvée, l'analyse post-HTS peut offrir une exploration plus approfondie, allant de la recherche d'analogues basée sur l’approche d’interaction ligand-structure accompagnée des analyses in silico jusqu’à la conception et la synthèse de nouvelles entités chimiques prometteuses. Cette analyse pertinente peut être adaptée à des composés individuels, à des modulateurs doubles ainsi qu'à des combinaisons optimisées de molécules actives.
Poster 17 Quantification de l’effet cytotoxique de traitements chimio-thérapeutiques sur des cellules gliales sans marquage, à l’aide de l’Intelligence Artificielle
Mathias Lucas1, Jasmine Trigg2, Daniel Porto3, Nevine Holtz3, Nicola Bevan2, Timothy Jackson2, Timothy Dale2, Gillian Lovell2 1. Sartorius France S.A.S. (présentateur) 2. Sartorius UK Ltd, Royston, Hertfordshire, UK 3. Sartorius Ann Arbor MI, USA
Le glioblastome multiforme (GBM) est un gliome agressif d’origine astrocytaire. Plusieurs obstacles existent dans son traitement (localisation de la tumeur dans le cerveau, hétérogénéité tumorale et résistance aux thérapies conventionnelles, …). Les progrès technologiques ont facilité l’adoption de modèles cellulaires plus avancés (cellules primaires, iPSC,…), plus proches des phénotypes humains mais dont la complexité peut nécessiter l’utilisation de méthodes analytiques non perturbatrices pour capturer avec précision des données biologiquement pertinentes. Nous décrivons ici une solution robuste pour la segmentation cellulaire et la classification vivantes/mortes des cellules individuelles sans marquage, à l’aide d’un logiciel intégré basé sur l’IA. Nous illustrons comment cette approche peut fournir des informations sur la réponse des cellules gliales à divers traitements chimio-thérapeutiques.
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Le CERMN et la Station Biologique de Roscoff vers l'illumination du Dark Kinome.
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